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关于致病菌全基因组测序服务的比选公告
各参选企业：
为工作需要，拟采购致病菌全基因组测序服务
欢迎符合要求的企业积极参加评选，比选要求如下：
一、参选公司资质要求
（一）投标人须提供以下资质材料：
1.企业营业执照[副本]复印件；
2.法定代表人身份证明材料复印件；
3.法人代表授权书原件及被授权人的身份证复印件（非法定代表人参选时提供）；
（二）投标人须提供如下承诺函原件：
1.具有独立承担民事责任的能力的合法供应商；
2.具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；
3.具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；
4.近三年内在经营活动中没有重大违法记录；
5.具备履行合同所必需的设备和专业技术能力的证明材料；
6.具备法律、行政法规规定的其他条件。
7.参加比选活动前三年内，供应商单位及其现任法定代表人、主要负责人不得具有行贿犯罪记录。
（上述资质材料均需加盖企业鲜章并胶装成册；供应商未提供或提供不完整视为资格不能满足本项目要求）
二、项目预算
预算35万元，最高限价35万元。
采购清单
三、技术要求
1.▲样品接收：我单位提供灭活菌株或菌株核酸样品，服务商配备专人负责样品的收集及运输，根据客户需求实时收取样品，样品需采用干冰进行运输，保障实验室样品的质量不因运输过程而受损。
2.检测设备技术：
（1）测序读长：利用二代测序平台，能完成双端150bp及以上测序，为确保测序数据的稳定性，供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序；
（2）准确度：数据准确度需Q30（99.9%）>85%；
（3）单碱基错误率低于十万分之一。
3.数据要求：
▲(1) 交付数据包括原始数据（rawdata和cleandata，数据格式为fastq）和拼接后数据（数据格式为fasta）。拼接后数据SCAFFOLD数量<100个，Contig数量<200个。
(2) PE150（双端测序，单向读长150bp）及以上测序。
▲(3) 原始数据量（碱基数）≥1.5G，Q20高质量数据量（Clean data）≥1G，碱基数据质量值Q30比例≥85%。
?(4) 覆盖度：碱基类型分布均匀，无GC分离；基因组10×覆盖度≥95%，基因区覆盖度≥98%，平均覆盖深度≥100×。
▲(5) 下机数据能满足上传国家网络需求。
4.质控要求：
▲(1) 每批样品收到后应立即开始核酸提取、质量检测等相应工作，使用Agilent、Qubit或NanoDrop进行样品浓度检测，电泳方法进行核酸样品完整性检测，核酸样品自收到之日起，于3日内提供样品质量检测报告。
(2) 核酸提取失败的灭活菌株样品，服务商不收取费用。
(3) 核酸样品质量检测结果：浓度不低于5ng/ul、总量不低于100ng，无严重RNA污染、无明显降解的样品，均为合格样品，非特殊情况，不得要求重新送样。
(4) 文库长度250-350bp，构建好的文库使用Agilent和ABI StepOnePlus Real-Time PCR System进行质量和产量的检测。
5.▲数据交付：每批样品自质量检测合格客户回复之日起，10天内交付数据。如遇样品质量检测合格，测序污染、失败等情况，服务商需立即启动免费加测，并于20日内交付全部加测样品的数据，如超过20日，则该批次样品不收取费用。
6.运行环境要求：测序平台完成ISO系列资质认证（ISO9001、CLIA证书等）。
（注：带▲项为重要参数。）
四、商务要求
（一）交货期及地点：
具体时间合同中约定，最晚不得晚于2023年11月30日完成。交货地点为四川省疾病预防控制中心业务楼B栋502。 ? ? ?
（二）付款方式：
项目完成收到乙方发票后，甲方将项目款一次性汇付到乙方账户。 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
★（三）数据的交付及保存
下机数据需能同时提供移动硬盘和网络下载的方式进行交付，网络下载方式数据下载期限不低于30天。测序下机后的原始数据服务商需保存一年。
★（四）安全保密要求
成交供应商应遵守国家法律法规，高度重视安全保密工作，成交供应商须与采购人签署保密协议，保密协议中应包含且不局限下述内容：
不透露采购人及采购人系统中的数据信息；
不得将采购方样本及其相关数据转交于第三方及境外组织等。
★（五）项目产权要求
在本项目所产生的技术成果（测序序列等）的全部知识产权归四川省疾病预防控制中心所有。项目结束时项目执行单位应提交项目执行的所有文档（包括文字资料和电子文件）。项目执行单位未经四川省疾病预防控制中心许可，不得在本项目以外使用。
（六）服务商应严格按照签订的服务合同执行，如测序污染、测序失败情况超过1次，或延迟交付数据3次以上，则记入中心该类服务项目中的违规记录一次。
（七）项目验收
在总数据量达标的情况下(1G)，利用fastQC系统检查每个文库数据量不低于目标数据量的90%，平均Q20≥95% ，平均Q30≥85%。
（八）如有需要，服务商需根据客户要求，到客户指定地点进行免费技术指导。
（注：带★项为实质性要求，在响应文件出具相应承诺函，不满足则视为参选无效。标注“▲”号的不作实质性要求，允许有负偏离，有负偏离的按 “综合评分表”对应描述执行）
五、评选标准：
综合评分法（附后）
六、样品及材料报送要求
请各参选公司根据项目要求提供相关资料及报价（资质材料一份，响应材料一式三份，一正两副；需加盖鲜章，胶装并密封），于2023年4月18日上午9:00-10:00交至省疾控行政楼510室杨老师处，过时将不再接受资料报送。
资料报送电话：(028)85587232
项目咨询电话：(028)87046206
四川省疾病预防控制中心
2023年4月11日
评选标准：
